By default a nucleotide is green if it occurs in the seed or red otherwise. Mature sequences are highlighted with under- and overlines.
In Ralee view, nucleotides are coloured by conservation (, , and ).
Hover over accession, bit score or taxonomic string to see more information
Seed consensus | . . . . . . . . . . A G C G U . . . . G U A . C C C U C A U C C . . . C A . . A C U U A A U G . U . U G . . . G A A . U G G A G . A U G G C C G U C C . . . . . . G A U U G G A U C C . U G C G A A G . . . . . . C . U . . U . C G G U G ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C A U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U U G G . U C A . C . A . . . C U U C G A U . U A C . A . . . A . . U A . C U G G . . . C A C G . G . A . . . C . U . . C . G A C U U C G . C U G G U C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . C . A . G A G C C ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ G U G . U C A U C U C A C C U U . . . . | ||||
Consensus structure | . . . . . . . . . . : : : : : . . . . : < - . < - - < < < _ _ _ . . . _ _ . . _ _ _ _ _ _ _ _ . _ . _ _ . . . _ _ _ . > > > - > . > , < < < < < - < < . . . . . . _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ . _ _ _ _ _ _ _ . . . . . . _ . _ . . _ . _ _ _ _ _ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ > > - > > > > > , , , , , , , , , . . , , . , , . , , < - - - - - - - - - . - - - . - . . . . . - - - . . - . - - - - - - - - . - - - - < < _ _ . _ . _ _ _ _ . _ > > . . . - - - - - - . - - - - - - - - - . - . - . - . - - - - . - - - . - . > . . . , , , , , , , . , , , . , . . . , . . , , . , , , , . . . < - < _ . _ . _ . . . _ . _ . . _ . _ _ _ _ _ _ _ . _ _ _ _ _ _ . _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ . _ . _ _ . . _ _ . _ . _ . _ _ _ _ _ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ ~ > - > . : : : : : : : : : : : : . . . . | ||||
65427926_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 255.4 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U C C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A A C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427940_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 255.1 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A G C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C A U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
CP001575.1/881552-881796 (+) | 255.1 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A G C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C A U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A U . C C G . A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Micromonas | |
CP001575.1/896734-896978 (+) | 255.1 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A G C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C A U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A U . C C G . A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Micromonas | |
CP001575.1/923403-923647 (+) | 255.1 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A G C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C A U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A U . C C G . A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Micromonas | |
65427931_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 254.4 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A C C C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A A C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427935_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 254.4 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A C C C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A A C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427930_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 253.8 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A C C C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A A C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C A G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427936_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 252.8 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A C C C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A A C C . U G U G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A A C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C C G . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427922_Micromonas_pusilla/1-246 (+) | 251.5 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A U . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G A A G C C . U G C A A A G . . . . . g C a U . . U . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U A U U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U U G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U U C A u C - G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . C . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427939_Micromonas_pusilla/1-246 (+) | 251.5 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A U . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G A A G C C . U G C A A A G . . . . . g C a U . . U . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U A U U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U U G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U U C A u C - G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . C . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427941_Micromonas_pusilla/1-246 (+) | 251.5 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A U . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G A A G C C . U G C A A A G . . . . . g C a U . . U . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U A U U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U U G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U U C A u C - G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . C . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427927_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 251.0 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A A C C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A G C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C A U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C U G . C G A G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C U U U . . . . | - | |
65427937_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 251.0 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A A C C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A G C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C A U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C U G . C G A G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C U U U . . . . | - | |
65427938_Micromonas_pusilla/1-245 (+) | 251.0 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A A C C . . . C A . . A - U U A A U U . U . U G . . . G G A . U G G A A . A U G G A C G U C C . . . . . . G A U C G G A G C C . U G C G A A G . . . . . g U . U . . U . C G A U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C A U . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . U A A . C . A . . . C U U C G A - . U C C g A . . . A . . U A . C U G G . . . U G C G u G . U . . . C . U . . C . G A C U C U G . C G A G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A A . U . A a G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . C C A U C U C A C U U U . . . . | - | |
GG663735.1/811368-811118 (-) | 238.5 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A C C U C A C G g U . U G . . . G A A . U G G A G . A U G G U C G U C C . . . . . . G G U U G G G U C C . U G C A A A G . . . . . g G . C . . U . C G G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A U C A A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C A G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G A . U C A u C . A . . . C U U C G A U . U A C . A a c a A . . C A . C U G G . . . C A C G . G a U . . . U . U . . C . G A C U C G G . G U G U U C . U U U A C G G A C G C . U . C G . . A A a C . A . G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U U U C A C C U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Micromonas | |
GG663735.1/823701-823451 (-) | 238.5 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A C C U C A C G g U . U G . . . G A A . U G G A G . A U G G U C G U C C . . . . . . G G U U G G G U C C . U G C A A A G . . . . . g G . C . . U . C G G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A U C A A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C A G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G A . U C A u C . A . . . C U U C G A U . U A C . A a c a A . . C A . C U G G . . . C A C G . G a U . . . U . U . . C . G A C U C G G . G U G U U C . U U U A C G G A C G C . U . C G . . A A a C . A . G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U U U C A C C U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Micromonas | |
395441212_Micromonas_pusilla/1-241 (+) | 234.6 | SEED | . . . . . . . . . . A G C G U . . . . G U A . C C C U C A U U C . . . U A . . A U U U A A C G a U . U A . . . G A G . U G G A G . A U G G G C G U C C . . . . . . G A U U G G G U U U u U A C A - A - . . . . . . C . - . . C . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G A C U G A A A G A C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U U . U . U U A - . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G G . A C A . C . A . . . C U U C G A A . U G C . A . . . A . a C A . C U G G . . . C A C G . U . - . . . U . U . . C . G A U U U C G . U U G G U C . U U U A C G A C U G A . U . G A . . A G . C . A . G A G G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U C U C A C C U U u u g a | - | |
65427928_Micromonas_pusilla/1-241 (+) | 234.6 | SEED | . . . . . . . . . . A G C G U . . . . G U A . C C C U C A U U C . . . U A . . A U U U A A C G a U . U A . . . G A G . U G G A G . A U G G G C G U C C . . . . . . G A U U G G G U U U u U A C A - A - . . . . . . C . - . . C . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G A C U G A A A G A C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U U . U . U U A - . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G G . A C A . C . A . . . C U U C G A A . U G C . A . . . A . a C A . C U G G . . . C A C G . U . - . . . U . U . . C . G A U U U C G . U U G G U C . U U U A C G A C U G A . U . G A . . A G . C . A . G A G G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427929_Micromonas_pusilla/1-241 (+) | 234.6 | SEED | . . . . . . . . . . A G C G U . . . . G U A . C C C U C A U U C . . . U A . . A U U U A A C G a U . U A . . . G A G . U G G A G . A U G G G C G U C C . . . . . . G A U U G G G U U U u U A C A - A - . . . . . . C . - . . C . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G A C U G A A A G A C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U U . U . U U A - . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G G . A C A . C . A . . . C U U C G A A . U G C . A . . . A . a C A . C U G G . . . C A C G . U . - . . . U . U . . C . G A U U U C G . U U G G U C . U U U A C G A C U G A . U . G A . . A G . C . A . G A G G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
567319984_Micromonas_pusilla/1-246 (+) | 233.6 | SEED | . . . . . . . . . . A G C G U . . . . G U A . C C C U C A U C C . . . C A . . A C C U - - C G g U . U G . . . G A A . U G G A G . A U G G G C G U C C . . . . . . G A U C G G G U C U c G G C G - A - . . . . . . C g A g g C u C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A A G C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U - . U . U A A U u A G G . . . A C G G A U . C G C U C G G U C . A . G . A . U C G G . A C A . C . A . . . C U U C G A U . U A C g A . . . A . . C A . C U G G . . . C A C G . G . A . . . U . U . . C . G C G U C G A . G U G G C C . C U C G C G G U C A G . U . C G . . A A . U . A . G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U C U C A C C U U u u g a | - | |
65427924_Micromonas_pusilla/1-240 (+) | 231.0 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U U C . . . U A . . A U U U A A C G a U . U A . . . G A G . U G G A G . A U G G G C G U C C . . . . . . G A U C G G G G C U . U - C G - G - . . . . . . C . U . . C . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G A C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U - . U . U U A C . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U C G G . A C A . C . A . . . C U U C G A A . C U U . A . . . A . . C A u C U G G . . . C G C G . U . - . . . U . U . . C . G A U U U C A . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A G . C . A . G A G G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C G . U C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
65427925_Micromonas_pusilla/1-240 (+) | 231.0 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U U C . . . U A . . A U U U A A C G a U . U A . . . G A G . U G G A G . A U G G G C G U C C . . . . . . G A U C G G G G C U . U - C G - G - . . . . . . C . U . . C . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G A C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U - . U . U U A C . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U C G G . A C A . C . A . . . C U U C G A A . C U U . A . . . A . . C A u C U G G . . . C G C G . U . - . . . U . U . . C . G A U U U C A . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A G . C . A . G A G G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C G . U C A U C U C A C C U U . . . . | - | |
290770760_Micromonas_pusilla/1-240 (+) | 230.3 | SEED | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U A . C C C U C A U U C . . . U A . . A U U U A A C G a U . U A . . . G A G . U G G A G . A U G G G C G U C C . . . . . . G A U C G G G G C U . U - C G - G - . . . . . . C . U . . C . C G G U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G A C A G . . U C . G C . G G U G C G A C C G A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U - . U . U U A C . A G G . . . A C G G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U C G G . A C A . C . A . . . C U U C G A A . C G U . A . . . A . . C A u C U G G . . . C G C G . U . - . . . U . U . . C . G A U U U C A . C G G G C C . C U C G C G G C U G G . U . G G . . A G . C . A . G A G G C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C G . U C A U C U C A C C U U u u g a | - | |
65427923_Micromonas_pusilla/1-248 (+) | 227.6 | SEED | . . . . . . . . . . - - - G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A C C U C A C G g U . U G . . . G A A . U G G A G . A U G G U C G U C C . . . . . . G G U U G G G U C C . U G C A A A G g . . . . g C . - . . U . C G G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A U C A A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C A G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G A . U C A u C . A . . . C U U C G A U . U A C a A . . c A . a C A . C U G G . . . C A C G . G . A . . . U u U . . C . G A C U C G G . G U G U U C . U U U A C G G A C G C . U . C G . . A A a C . A . G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U U U C A C C U U . . . . | - | |
65427932_Micromonas_pusilla/1-248 (+) | 227.6 | SEED | . . . . . . . . . . - - - G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A C C U C A C G g U . U G . . . G A A . U G G A G . A U G G U C G U C C . . . . . . G G U U G G G U C C . U G C A A A G g . . . . g C . - . . U . C G G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A U C A A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C A G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G A . U C A u C . A . . . C U U C G A U . U A C a A . . c A . a C A . C U G G . . . C A C G . G . A . . . U u U . . C . G A C U C G G . G U G U U C . U U U A C G G A C G C . U . C G . . A A a C . A . G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U U U C A C C U U . . . . | - | |
65427933_Micromonas_pusilla/1-248 (+) | 227.6 | SEED | . . . . . . . . . . - - - G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A C C U C A C G g U . U G . . . G A A . U G G A G . A U G G U C G U C C . . . . . . G G U U G G G U C C . U G C A A A G g . . . . g C . - . . U . C G G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A U C A A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C A G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G A . U C A u C . A . . . C U U C G A U . U A C a A . . c A . a C A . C U G G . . . C A C G . G . A . . . U u U . . C . G A C U C G G . G U G U U C . U U U A C G G A C G C . U . C G . . A A a C . A . G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U U U C A C C U U . . . . | - | |
65427934_Micromonas_pusilla/1-248 (+) | 227.6 | SEED | . . . . . . . . . . - - - G U . . . . G U A . C C C U C A U A C . . . C A . . A C C U C A C G g U . U G . . . G A A . U G G A G . A U G G U C G U C C . . . . . . G G U U G G G U C C . U G C A A A G g . . . . g C . - . . U . C G G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A G G C A G . . U C . G C . G G U G C G A U C A A U . C G C . A . . . . . C G A . . U . C A G C G U G G . U A G A C C U A . U . U C U U . A G G . . . A C A G A U . C G C U C G A U C . A . G . A . U U G A . U C A u C . A . . . C U U C G A U . U A C a A . . c A . a C A . C U G G . . . C A C G . G . A . . . U u U . . C . G A C U C G G . G U G U U C . U U U A C G G A C G C . U . C G . . A A a C . A . G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G U G . U C A U U U C A C C U U . . . . | - | |
CAID01000012.2/111830-111557 (-) | 85.0 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U U . U C C U C A C C C . . . A C u u C C A U U G U G . U . U G . . u G C G . U G G A U . G U G G C C G U C C . . . . . . G G C U G G U G U G . U G A U U C A u u u g a c A . C . . A . C C G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A A A C A G . . U U . G C . A G U G C G C C C G - U . C G C . A . . . . . C G A . . C . C A G C G U G G . U A G A C C A C . C . C C G G . U G G . . . A C G - A U . C G C U C G G U U . U . G . A c G U G G . U G U . U . G . . . A C U C G C G . - - - . - . . . - . . - - . - - - - . . . - - - - . - . - . . . - . - . . - . - - - - - - - . - - - - - - . - - - - - - - - - - - . - . - - . . - - . - . - . - - - - - a g a u u u g g u g g a u u u g u a u u c g a c c a a a g a c c u g u g c a u u u . . g g g c g g c g c u g g g a u u g u a u g a u c c u g u g c c g a u c c a u c g u a - - - . U G - C U U C A C C U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Ostreococcus | |
CP000588.1/496416-496677 (+) | 82.2 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U U . U C C U C A A A C . . . A C . . C U C C A G U G . U . U - . . . - - - . U G G A U . A U G G C C G U C C g g . . c g G U G C G A G U U U . U A U C G C A . . . . . . C . U . . U . C - G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A A A C A G . . U U . G C . A G U G C G U - C A G U . C G C . A . . . . . C G A . . C . C A G C G U G G . U A G A C C A C . U . C C G G . U G G . . . A C G - A U . C G C U C G G U U . U . G . G . C U G G . C G U . G . U . . . - C U C - - - . - - - . - . . . - . . - - . - - - - . . . - - - - . - . - . . . - . - . . - . - - - - - - - . - - - - - - . - - - - - - - - - - - . - . - - . . - - . - . - . - - - - - g c g a g a u u u g g g g g a u u u a u u c c g c c c g a a g a c c u g u g c g u u u g g g c g c c c a u g g a u g c a u u u u g u g u c u u g g u c g a c c c u c g u a - - - . A C G C U U C A C C U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Ostreococcus | |
CP000592.1/125862-125601 (-) | 82.1 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U U . U C C U C A A A C . . . A C . . C U C C A G U G . U . U - . . . - - - . U G G A U . A U G G C C G U C C g g . . c g G U G C G A G U U U . U A U C G C A . . . . . . C . U . . U . C - G C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C G G C U G A A A A A C A G . . U U . G C . A G U G C G U - C A G U . C G C . A . . . . . C G A . . C . C A G C G U G G . U A G A C C A C . U . C C G G . U G G . . . A C G - A U . C G C U C G G U U . U . G . G . C U G G . C G U . G . U . . . - C U C - - - . - - - . - . . . - . . - - . - - - - . . . - - - - . - . - . . . - . - . . - . - - - - - - - . - - - - - - . - - - - - - - - - - - . - . - - . . - - . - . - . - - - - - g c g a g a u u u g g g g g a u u u a u u c c g c c c g a a g a c c u g u g c g u u c g g g c g c c c a u g g a u g c a u u u u g u g u c u u g g u c g a c c c u c g u a - - - . A C G C U U C A C C U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Ostreococcus | |
FO082268.1/122305-122539 (+) | 76.9 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U C . U C C U C A C C U . . . C A . . C U U U U A U U . U . U U g . a G C G . U G G A U . C U G G G C G U C C g g a a u c U U U U G - - - - - . - - - - - - - . . . . . . - . - . . - . - - - - - u u u u a u u g a a a g a c u c g G G U C G C C U G A A A A A C A G . . U C . G U a C G U G C G A C U G - U . C G C . A . . . . . U A A . . C . C A A C G U G G . U A G A C C A C . U . C C G G . U G G . . . A C G - A U . C G U U C G G U U . U . G . A . C A G U . U G U . U u A . . . C C U A - - - . - - - . - . . . - . . - - . - - - - . . . - - - - . - . - . . . - . - . . - . - - - - - - - . - - - - - - . - - - - - - - - - - - . - . - - . . - - . - . - . - - - - - a g u a u g a u c u c g a c c g a a u u u a u u . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . u c c g u g u c g a a a c c u g u g c u u u u u u - - - . A C U C C G C A C U U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Bathycoccus | |
FO082268.1/37535-37301 (-) | 76.9 | FULL | . . . . . . . . . . A G U G U . . . . G U C . U C C U C A C C U . . . C A . . C U U U U A U U . U . U U g . a G C G . U G G A U . C U G G G C G U C C g g a a u c U U U U G - - - - - . - - - - - - - . . . . . . - . - . . - . - - - - - u u u u a u u g a a a g a c u c g G G U C G C C U G A A A A A C A G . . U C . G U a C G U G C G A C U G - U . C G C . A . . . . . U A A . . C . C A A C G U G G . U A G A C C A C . U . C C G G . U G G . . . A C G - A U . C G U U C G G U U . U . G . A . C A G U . U G U . U u A . . . C C U A - - - . - - - . - . . . - . . - - . - - - - . . . - - - - . - . - . . . - . - . . - . - - - - - - - . - - - - - - . - - - - - - - - - - - . - . - - . . - - . - . - . - - - - - a g u a u g a u c u c g a c c g a a u u u a u u . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . u c c g u g u c g a a a c c u g u g c u u u u u u - - - . A C U C C G C A C U U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Chlorophyta; Mamiellophyceae; Mamiellales; Bathycoccus | |
371782109_Prasinococcus_capsulatus/1-266 (+) | 61.7 | SEED | . . . . . . . . . . G U C G U . . . . - U G . U C C U C A C C C . . . C C . . C - U U U G C G . - . - G . . . G A G g U G G A G c A U G G C C C U C C . . . . . . G A - - G - A - C C . G G A G - A - . . . . . . C g G . . U . C - - U G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U U G G C U G A A G C G C A G c c U C c G C . C C U G C C U U A G A U g C G C . A . . . . . G G C c c C . C A - U G U G G . U A G A C U G G c U . A C G C . U G G u a u A U G U G U . C G - U - G G G - . A . G c A . C U G G . C G G . C . A g g g A G U G G A G g U A A . A g . c A g g A A . C G G G a g a C G C G g G g A g g g C . U g g C a G A G U G C G . G U G - U C g C A A G A G A C C G G c U c G G c g A G c C c A . C C G A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G C G c U C C U C A - A C C U U u g g . | - | |
168824108_Nephroselmis_pyriformis/11-231 (+) | 54.3 | SEED | u c u c u g g c u c A G C G U c g a u G U A u C C C U C A U C C a a a C A . c A C C C C U U G . U g U G c u u G A A . U G G A U . C U G G C C G U C C c g . . g c G U U U G - A - C U . U G U U C A A . . . . . . A . A . . G . C - - C G . . . . . . . . . . . . . . . . . G G U C U G C U G A A G C G C A G . . A G . G C u A A U - C A A - G G A C . C C U u A u . . g g C G C . . C g C A U C U A G G u U A G U - U A G . C a U C A C . U G - . . . C U A C A U a C A - U A G G U U g U u G . G c U U G G c U C U . U g A . . . G U C U G C C c U C U . A . . . A . . - A . C C A - . . . - A - G . A . - . . . - . - . . - . A A - - - - A . - - A - - C . C U - - - - - - U - - . U . - - . . - - . - . A . - - - C U . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - U - . U U - U C G - A - - - - . . . . | - | |
BANV01003055.1/950-724 (-) | 44.9 | FULL | . . . . . . . . . . A U U A U . . . . A A C . A C C U C A C A A . . . C C . . C U U U U A G G . - . - G . . . U A G . U G G A U . C U G G C C G U C C . . . . . . G G - - - - A - - - . - - - - - - - . . . . . . - . - . . - . - - - - - c u c u c . . . . . . g a g c c u G G U C G G C U G A A A G G C A G . . A U . G C . A A A G C C A G - C A G . C C C . A u u c a a C G G . . C a A G G C G U G G . U A G A C C G C . A . U C G C . G G G . . . C - - G A U . C G - U C G U G C . C . G . G . - - G G . C C G . C . U . . . U U U U G G C c U U C . - . . . G . . C A . U U A G . . . C A G G . A . A . . . C . C g c C . G C U C C C G . A U G G A C . U U - - - - - - C G G . U c C G . . A A a G . G . G A G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . - G G . C C U U G A C C C A U U . . . . | 🌿 Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Klebsormidiophyceae; Klebsormidiales; Klebsormidiaceae; Klebsormidium | |
✅ CURRENT GA THRESHOLD: 44.00 BITS |